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Assessing variability in the ratio of metal concentrations measured by DGT-type passive samplers and spot sampling in European seawaters ArchiMer
Rodríguez, Jose German; Amouroux, Isabelle; Belzunce-segarra, María Jesús; Bersuder, Philippe; Bolam, Thi; Caetano, Miguel; Carvalho, Inês; Correia Dos Santos, Margarida; Fones, Gary R.; Gonzalez, Jean-louis; Guesdon, Stephane; Larreta, Joana; Marras, Barbara; Mchugh, Brendan; Menet-nédélec, Florence; Menchaca, Iratxe; Gabet, Vanessa Millán; Montero, Natalia; Nolan, Martin; Regan, Fiona; Robinson, Craig D.; Rosa, Nuno; Sanz, Marta Rodrigo; Schintu, Marco; White, Blánaid; Zhang, Hao.
The current study evaluates the effect of seawater physico-chemical characteristics on the relationship between the concentration of metals measured by Diffusive Gradients in Thin films (DGT) passive samplers (i.e., DGT-labile concentration) and the concentrations measured in discrete water samples. Accordingly, Inductively Coupled Plasma Mass Spectrometry (ICP-MS) was used to measure the total dissolved metal concentrations in the discrete water samples and the labile metal concentrations obtained by DGT samplers; additionally, lead and cadmium conditional labile fractions were determined by Anodic Stripping Voltammetry (ASV) and total dissolved nickel was measured by Cathodic Stripping Voltammetry (CSV). It can be concluded that, in general, the median...
Tipo: Text Palavras-chave: EU Water Framework Directive; Diffusive Gradients in thin-films (DGT); Passive samplers.
Ano: 2021 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00688/80043/83034.pdf
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Ballast water research in France : Current status ArchiMer
Masson, Daniel; Courtois, Olivier; Masson, Nadine; Guesdon, Stephane; Rocher, Gregory.
Due to important economic activities along the French oastline, the introduction of noxious organisms into French coastal waters, particularly by ship ballast water, may have serious consequences. After preliminary studies of ship movements in Charente Maritime, several samplings of ballast water and sediment were made. Samples were taken in five major harbours in France, along the Atlantic, Channel and Mediterranean coastlines. The main task of this first assessment was the research for exotic and possibly noxious phytoplancton. Clostridium and Vibrio bacteria were also tested for. The results are presented and discussed, with plans for further work.
Tipo: Text Palavras-chave: Bacteria; Phytoplancton; French coastal waters; Ballast water.
Ano: 2000 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2000/acte-7364.pdf
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Bassin Adour-Garonne : hydrologie et phytoplancton – Résultats 2013-2018 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Gouriou, Laure; Lissardy, Muriel; Sanchez, Florence; De Casamajor, Marie-noelle; Morandeau, Gilles; Ganthy, Florian; Trut, Gilles; Trut, Florence; Caill-milly, Nathalie; Oger-jeanneret, Helene; Guesdon, Stephane; Chabirand, Jean-michel; Morin, Dimitri; Piraud, Aude; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bruneau, Audrey; Soudant, Dominique; Gautier, Emeric; Michel, Valérie; Dupin, Michel.
Ce rapport rend compte des résultats sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton acquis dans le cadre de la DCE (contrôle de surveillance entre 2013 et 2018), dans les masses d’eau côtières et de transition du bassin Adour-Garonne
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau; Hydrologie; Phytoplancton.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00516/62735/67113.pdf
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Bassin Adour-Garonne : Hydrologie et phytoplancton - Résultats 2015-2019 ArchiMer
Auby, Isabelle; D'Amico, Florence; Meteigner, Claire; Rumebe, Myriam; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Gouriou, Laure; Lissardy, Muriel; Sanchez, Florence; De Casamajor, Marie-noelle; Morandeau, Gilles; Ganthy, Florian; Trut, Gilles; Trut, Florence; Caill-milly, Nathalie; Antajan, Elvire; Guesdon, Stephane; Chabirand, Jean-michel; Morin, Dimitri; Genauzeau, Sylvie; Piraud, Aude; Geairon, Philippe; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Thomas, Gerard; Bruneau, Audrey; Soudant, Dominique; Gautier, Emeric; Michel, Valérie; Dupin, Michel.
Ce rapport rend compte des résultats sur les paramètres hydrologiques et le phytoplancton acquis dans le cadre de la DCE (contrôle de surveillance entre 2014 et 2019), dans les masses d’eau côtières et de transition du bassin Adour-Garonne
Tipo: Text Palavras-chave: Directive Cadre sur l’Eau; Hydrologie; Phytoplancton.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00653/76529/77618.pdf
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Does global warming favour the occurrence of recent blue mussel mortality events in France? ArchiMer
Pepin, Jean-francois; Soletchnik, Patrick; Le Moine, Olivier; Polsenaere, Pierre; Genauzeau, Sylvie; Robert, Stephane; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Schmitt, Anne; Chabirand, Jean-michel; Tourbiez, Delphine; Travers, Marie-agnes; Guesdon, Stephane.
We report in this work data of two independent studies carried out in the Pertuis Charentais for which a link might exist? A 30-years local time series study of hydro-climatic variations in water temperature and salinity, which show a significant warming of the water masses in the Marennes Oleron bay (+ 1.5 °C) associated with a significant drop ( > -15%) of freshwater intakes by nearby rivers. In this changing local climate context several major epizootics have appeared, severely affecting farmers and the production of Pacific oysters and mussels, from the first French shellfish-producing department (catching and growing, Agreste, 2012). Following massive mortality event of blue mussels in 2014, a specific study (MORBLEU) is conducted, trying to...
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52697/53567.pdf
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Effect of local hydroclimate on phytoplankton groups in the Charente estuary ArchiMer
Guesdon, Stephane; Stachowski-haberkorn, Sabine; Lambert, Christophe; Beker, Beatriz; Brach-papa, Christophe; Auger, Dominique; Bechemin, Christian.
This study aimed to describe seasonal variations of phytoplankton abundances in relation to the physical and chemical (nutrients and metals) environment under the influence of freshwater input in the Charente river estuary (Marennes-Oléron bay, France) over three years, from 2011 to 2014. Phytoplankton abundances were determined using microscopy and flow cytometry. Considering high frequency temperature and salinity data, breakpoints in each series led to the identification of two local hydroclimatic periods: the first (2011 and early 2012) being warmer and higher in salinity than the second (from spring 2012 to the beginning of 2014). A multiblock PLS analysis highlighted the significant contribution of the physical environment (temperature, salinity and...
Tipo: Text Palavras-chave: Hydroclimate; Estuary; Phytoplankton; Size composition; Nutrients; Trace metals.
Ano: 2016 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00349/46005/45674.pdf
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Effets de l'hydroclimat local sur les groupes de phytoplancton dans l'estuaire de la Charente ArchiMer
Guesdon, Stephane; Stachowski-haberkorn, Sabine; Lambert, Christophe; Beker, Beatriz; Brach-papa, Christophe; Auger, Dominique; Bechemin, Christian.
Cette étude s’inscrit dans le cadre du projet TOPHYPAC (2011-2014) financé par le programme “Pesticides” du Ministère de l’Écologie, du Développement durable et de l’Énergie. Ce travail vise à décrire les variations saisonnières des abondances de phytoplancton en lien avec l'environnement physique et chimique (nutriments et métaux) de l'estuaire de la Charente de 2011 à 2014. À partir des données d'abondances de groupes phytoplanctoniques déterminés par microscopie et par cytométrie de flux, les contributions relatives des variables environnementales sur la dynamique du phytoplancton ont été évaluées : dans ce but, une analyse PLS multibloc a été réalisée. Celle-ci souligne une contribution importante de l'environnement physique (température, salinité et...
Tipo: Text
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00361/47173/47139.pdf
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Etude de la qualité des eaux d'alimentation de l'écloserie de la Ferme Marine de Douhet (FMD), pour une amélioration de la survie larvaire de la daurade royale (Sparus aurata) ArchiMer
Hussenot, Jerome; Mornet, Francoise; Le Moine, Olivier; Geairon, Philippe; Guesdon, Stephane.
This study aimed to analyse the quality of the sea water flowing into the marine farm of Douhet, a gilthead bream hatchery, from the marsh-seawater reservoir to the entrance of the hatchery. The basin-seawater reservoir is not stratified in the pumping area. As a consequence, the measurements carried out at the surface to the right of the pumping dock give a good evaluation of the quality of the seawater pumped in depth. The high sensitivity of gilthead bream larvae to the water PH during the first two weeks of their larval life, and the values measured in the circuit seem to be an explanatory parameter to the observed mortalities. The water flowing into the hatchery retains, after pre-treatment, a nycthemeral PH variability, with maxima, at the end of the...
Tipo: Text Palavras-chave: Ammonia nitrogen; PH; Sea bream; Fish hatchery; Reservoir; Water quality; Azote ammoniacal; PH; Daurade royale; Ecloserie; Réserve; Qualité des eaux.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/rapport-6497.PDF
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Etude des eaux de ballast de navires faisant escale dans les ports français ArchiMer
Masson, Daniel; Courtois, Olivier; Masson, Nadine; Guesdon, Stephane; Rocher, Gregory; Margat, Sylvie.
The carrier ship's deballasting activity in french ports and coastal areas can introduce unwanted or noxious species,with detrimental economical and sociological consequences upon shore based activities ; These activities represent one of the most preeminent sources for employment and incomes along the french coasts ,via coastal fishing,aquaculture,tourism. A ship's ballast water study in sorne french ports has been carried out ,to seek for presence of harmfull or pathogenic organisms.Results let appear pathogenic bacteriae in half of the ships,and weIl known toxic phytoplancton species (from Spain ,north Africa) The technical problem of ballast water treatment is considered.
Tipo: Text Palavras-chave: Toxic phytoplankton; Introduced species; Shipping; Ballast waters; Phytoplancton toxique; Introduction d'espèces; Transport maritime; Eaux de ballast.
Ano: 2000 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2000/rapport-6312.pdf
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Evaluation du risque d'introduction d'espèces indésirables par l'intermédiaire des eaux de ballast des navires - Deuxième partie ArchiMer
Masson, Daniel; Courtois, Olivier; Masson, Nadine; Guesdon, Stephane; Rocher, Gregory; Margat, Sylvie.
L'activité de transport maritime dans les eaux côtières et les ports français nécessite que les navires ballastent ou déballastent pour décharger ou prendre du frêt. L'eau de mer (ou d'estuaire) rejetée à cette occasion a souvent été prise aux escales précédentes dans d'autres parties du monde et peut contenir des organismes vivants néfastes pour la faune, la flore, ou l'activité économique des régions côtières françaises. Il en est de même des eaux françaises prises comme ballast. Certaines espèces peuvent proliférer dans un nouveau milieu où les facteurs de leur régulation n'existent plus et devenir envahissantes (jacinthes d'eau en Floride ou moules zébrées dans les Grands Lacs). Les plus néfastes sont les bactéries et le phytoplancton toxique....
Tipo: Text Palavras-chave: Introduction espèces; Eaux de ballast; France.
Ano: 2000 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00191/30228/28642.pdf
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Expertise Ifremer sur le suivi des pesticides et des métaux lourds dans le cadre du programme conchylicole 2016 de Charente-Maritime ArchiMer
Amouroux, Isabelle; Guesdon, Stephane.
La Direction du Développement Durable et de la Mer, sollicite l’expertise de l’Ifremer sur le réseau de suivi pesticide qu’il souhaite intégrer au programme conchylicole 2016. Ce réseau prévoit le suivi de « pesticides dans les coquillages (huîtres) et l’eau côtière à proximité des zones à risque (exutoires de marais doux, estuaires, etc..) ». L’expertise de l’Ifremer est sollicitée sur : le choix des substances (métaux lourds et pesticides) à suivre, les matrices de suivi (coquillages, eaux) et les lieux de prélèvement.
Tipo: Text
Ano: 2016 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00405/51654/79631.pdf
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Haemocytes from Crassostrea gigas and OsHV-1: A promising in vitro system to study host/virus interactions ArchiMer
Morga, Benjamin; Faury, Nicole; Guesdon, Stephane; Chollet, Bruno; Renault, Tristan.
Since 2008, mass mortality outbreaks associated with the detection of particular variants of OsHV-1 have been reported in Crassostrea gigas spat and juveniles in several countries. Recent studies have reported information on viral replication during experimental infection. Viral DNA and RNA were also detected in the haemolymph and haemocytes suggesting that the virus could circulate through the circulatory system. However, it is unknown if the virus is free in the haemolymph, passively associated at the surface of haemocytes, or able to infect and replicate inside these cells inducing (or not) virion production. In the present study, we collected haemocytes from the haemolymphatic sinus of the adductor muscle of healthy C. gigas spat and exposed them in...
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00399/50997/51780.pdf
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Hydrologie : des mesures sur l'eau ArchiMer
Guesdon, Stephane; Soletchnik, Patrick.
Ce poster présente les stratégies spatio temporelles de mesures hydrologiques dans les pertuis charentais; (1) la "basse fréquence", par prélèvements d'échantillons d'eau de mer et (2) la "haute fréquence", par mesure in situ à partir de sonde multi paramètres immergées. Les objectifs de ces réseaux sont la surveillance et la recherche. Un exemple de déssalure "furtive" est présenté en rivière Seudre
Tipo: Text Palavras-chave: Marennes Oléron Bassin; Nutriment; Oxygène dissous; Chlorophylle; Matières en suspension; Turbidité; Salinité; Température; Hydrologie.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/acte-4039.pdf
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Microbial balance, and triggering of recent mussel mortality events in France: Is there a link? ArchiMer
Guesdon, Stephane; Travers, Marie-agnes; Hervio Heath, Dominique; Derrien, Annick; Genauzeau, Sylvie; Schmitt, Anne; Quintric, Laure; Leroi, Laura; Pepin, Jean-francois.
Since the spring of 2014, the mussel farming of Charente-Maritime and Vendée (French Atlantic coast) has experienced an unprecedented crisis. Mass mortality events of blue mussel (M. edulis) have affected livestock areas, decimating up to 100% of production in some farming areas. Investigation for infectious agents in moribund mussels revealed presence of bacteria capable of inducing mortalities. In this context, the MORBLEU research project (DPMA-Ifremer agreement) was initiated to explore potentially aggravating factors, associated or correlated with mortality of mussels. The aim of the present study is to support the hypothesis that these mortality episodes can be linked to an evolution of microbial communities. Based on historical data from Ifremer...
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52696/53566.pdf
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MONITOOL : New tools for monitoring the Chemical status in transitional and coastal waters under the Water Framework Directive ArchiMer
Larreta, Joana; Amouroux, Isabelle; Belzunce Segarra, Maria Jesus; Bersuder, Philippe; Bettoschi, Alexandre; Bolam, Thi; Caetano, Miguel; Carvalho, Ines; Portela Correia Dos Santos Romao, Margarida Maria; Franco, Javier; Gonzalez, Jean-louis; Guesdon, Stephane; Marras, Barbara; Mchugh, Brendan; Menchaca, Iratxe; Menet-nedelec, Florence; Merkel, Daniel; Millan Gabet, Vanessa; Montero, Natalia; Nolan, Martin; Perceval, Olivier; Regan, Fiona; Robinson, Craig; Rodrigo Sanz, Marta; Rodriguez, José German; Rosa, Nuna; Schintu, Marco; White, Blanaid.
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00620/73186/72375.pdf
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Mortalités de moules bleues dans les Pertuis Charentais: description et facteurs liés – MORBLEU ArchiMer
Travers, Marie-agnes; Pepin, Jean-francois; Soletchnik, Patrick; Guesdon, Stephane; Le Moine, Olivier.
Depuis 2014, des surmortalités anormales affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles avec des mortalités massives pouvant atteindre 100% (Béchemin et al. 2015). Les objectifs généraux de ce projet sont d’identifier des facteurs potentiellement corrélés avec les mortalités de moules observées dans les Pertuis Charentais: facteurs environnementaux biotiques, abiotiques et hydrodynamiques) et facteurs intrinsèques aux animaux (traits d'histoire de vie, qualité cytogénétique et physiologie). Après une introduction bibliographique complète, différentes questions sont ici abordées. 1. Historique des mortalités 2014-2015 ? Grâce { différentes sources d’information nous avons pu retracer les évènements de mortalités de 2014 et 2015 et valider...
Tipo: Text Palavras-chave: Moules; Mytilus edulis; Fluctuations environnementales; Connectivité hydrodynamique; Populations; Qualité cytogénétique; Immunité; Physiologie.
Ano: 2016 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00324/43539/43096.pdf
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Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles charentais et vendéens : description et facteurs liés – MORBLEU ArchiMer
Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Degremont, Lionel; Guesdon, Stephane; Le Moine, Olivier; Morga, Benjamin; Bierne, Nicolas; Travers, Marie-agnes; Robert, Stephane; Soletchnik, Patrick.
Depuis 2014, des épisodes de mortalité anormale affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles. Dès l’année 2015, une première année d’étude a été réalisée au travers de l’action MORBLEU (Mortalité des moules Bleues). Elle a été menée dans les Pertuis charentais et la baie de Bourgneuf. Dans ce même contexte, elle a été reconduite en 2016 afin de poursuivre l’analyse des données collectées en 2015, renouveler une campagne d’étude et d’observation in situ, formuler des hypothèses autour de facteurs favorisants ces épisodes de mortalité de moules, développer des essais permettant de tester ces hypothèses dans le futur et produire des lots de moules pour ces essais et pour caractériser le potentiel adaptatif des animaux face aux épisodes de...
Tipo: Text Palavras-chave: Moules; Mytilus edulis; Facteurs environnementaux; Mortalité; Equilibre microbien; Populations; Qualité cytogénétique; Anomalies hémocytaires; Expression de gènes; Physiologie.
Ano: 2017 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00391/50288/50978.pdf
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Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles : description et étude des facteurs liés, action –MORBLEU-2017 ArchiMer
Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Bierne, Nicolas; Costes, Louis; Degremont, Lionel; Garcia, Celine; Guesdon, Stephane; Lamy, Jean-baptiste; Le Moine, Olivier; Morga, Benjamin; Normand, Julien; Robert, Stephane; Saunier, Alice; Soletchnik, Patrick; Travers, Marie-agnes.
Depuis 2014, des épisodes de mortalité anormale affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles. Dès l’année 2015, une étude spécifique cofinancée par la DPMA et réalisée par l’Ifremer a été initiée, l’action de recherche MORBLEU (Mortalité des moules Bleues). Les années 2015 et 2016 ont permis de dégager des éléments de connaissance et des pistes relatifs aux facteurs biotiques et abiotiques qui semblent intervenir dans le phénomène de hausse de mortalité des moules depuis 2014. Pour l’année 2017, les trois objectifs principaux étaient de : i) poursuivre la description du phénomène de mortalité ainsi que le contexte environnemental associé en effectuant une nouvelle campagne d’études et d’observations in situ, ii) tester des hypothèses...
Tipo: Text Palavras-chave: Moules; Mytilus edulis; Mortalité; Statut cytogénétique; Anomalies génomiques; Populations; Facteurs environnementaux; Ecologie microbienne.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00503/61503/65337.pdf
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Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles : description et étude des facteurs liés, action – MORBLEU-2018 ArchiMer
Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Bierne, Nicolas; Chasselin, Leo; Degremont, Lionel; Guesdon, Stephane; Lamy, Jean-baptiste; Le Moine, Olivier; Normand, Julien; Robert, Stephane; Soletchnik, Patrick.
Depuis 2014, des épisodes de mortalité anormale affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles. Dès l’année 2015, une étude spécifique cofinancée par la DPMA et réalisée par l’Ifremer a été initiée, l’action de recherche MORBLEU (Mortalité des moules Bleues). Les années 2015- 2017 ont permis de dégager des éléments de connaissance et des pistes relatifs aux facteurs biotiques et abiotiques qui semblent intervenir dans le phénomène de hausse de mortalité des moules depuis 2014. Pour l’année 2018, les actions d’observation et de suivis du milieu et des moules ont été fortement réduites et trois axes principaux ont été poursuivis : i) l’étude de la relation entre l’évolution des équilibres microbiens planctoniques et l’apparition de mortalités...
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00588/70056/67999.pdf
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Mortalités massives de l'huître creuse - Rapport final du programme de recherche sur l'étude de la cinétique de détection d'agents infectieux associés à des épisodes de mortalités de naissains d'huîtres creuses Crassostrea gigas sur un site ostréicole de Marennes-Oléron (CIDAGINF 2009-2010) ArchiMer
Saulnier, Denis; Pepin, Jean-francois; Guesdon, Stephane; Degremont, Lionel; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Renault, Tristan; Travers, Marie-agnes; Tourbiez, Delphine; Geairon, Philippe; Le Moine, Olivier; Seugnet, Jean-luc; Soletchnik, Patrick.
This study aims to improve understanding of causes of mortalities in oyster Crassostrea gigas in pertuis charentais related to environmental parameters and the kinetics of targeted infectious agents, such as bacteria Vibrio splendidus (group ) and V. aestuarianus and Ostreid herpesvirus OsHV-1. Two sampling campaigns were carried out on the site of Agnas in 2009 and 2010, before, during or following mortality events of spat from March to September. The approach is to detect and quantify in short time step infectious agents from tissues of farmed oysters placed on rack and in various samples taken nearby: native oysters and other species (wild mussels and barnacles), seawater and sediment. With physical and chemical automatic probes placed on the site,...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Mortalité; Virus herpès; Vibrions; Environnement; Pertuis Charentais; Pacific oyster; Crassostrea gigas; Mortality; Herpes virus; Vibrios; Environment; Pertuis Charentais.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00058/16920/14400.pdf
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